Desktopowy klient Amazon WorkSpaces Applications udostępnia dwa tryby pracy: tryb aplikacji natywnej (Native application mode) i tryb klasyczny (Classic mode). Wybrany tryb pracy wpływa na dostępne opcje oraz sposób pracy i wyświetlania aplikacji uruchomionych wirtualnie.
Pasek narzędziowy desktopowej aplikacji Amazon WorkSpaces Applications >>
Tryb klasyczny (Classic mode)
Korzystając z klasycznego trybu aplikacji, możesz pracować z aplikacjami uruchamianymi wirtualnie w oknie wirtualnego pulpitu Amazon WorkSpaces Applications. Podczas jednej sesji można otwierać wiele aplikacji, ale wszystkie aplikacje wyświetlane będą w jednym oknie wirtualnego pulpitu.
Aplikacje dostępne do uruchomienia dostępne są w menu pod przyciskiem 
.
Natywny tryb aplikacji (Native application mode)
Tryb aplikacji natywnej umożliwia pracę z uruchamianymi wirtualnie aplikacjami w podobny sposób, w jaki pracuje się z aplikacjami zainstalowanymi na komputerze lokalnym.
Kiedy łączysz się z Amazon WorkSpaces Applications w trybie aplikacji natywnej, otwiera się okno Amazon WorkSpaces Applications Application Launcher i wyświetla listę aplikacji dostępnych do wirtualnego uruchomienia. Po uruchomieniu aplikacji w tym trybie okno Amazon WorkSpaces Applications pozostanie otwarte, a sama aplikacja otworzona zostanie we własnym oddzielnym oknie (jak aplikacja uruchamiana lokalnie).
Ikona aplikacji jest wyświetlana na pasku zadań lokalnego komputera, podobnie jak ikony aplikacji lokalnych.
W przeciwieństwie do ikon aplikacji lokalnych, ikony aplikacji uruchamianych wirtualnie w trybie aplikacji natywnych zawierają logo Amazon WorkSpaces Applications.
Podczas sesji wirtualnej Amazon WorkSpaces Applications możesz szybko przełączać się między aplikacjami zainstalowanymi lokalnie a aplikacjami uruchamianymi wirtualnie, klikając ikonę aplikacji zdalnej lub lokalnej na pasku zadań, z którą chcesz pracować.
Widok pulpitu
Po podłączeniu do usługi Amazon WorkSpaces Applications i wybraniu Desktop view, dostępy jest standardowy widok pulpitu systemu Windows dla wirtualnej sesji. Ikony aplikacji, które można uruchomić, pojawią się na pulpicie systemu Windows. Ponadto pasek narzędzi Amazon WorkSpaces Applications, który umożliwia skonfigurowanie ustawień sesji wirtualnej (pojawi się w lewym górnym obszarze okna wirtualnej sesji).
Jak przełączać tryby połączenia Amazon WorkSpaces Applications
Po uruchomienia wirtualnej sesji aplikacji Amazon WorkSpaces Applications możesz przełączać się między trybem natywnym aplikacji a trybem klasycznym.
Aby przejść z trybu aplikacji natywnej do trybu klasycznego
1.W lewym górnym rogu okna uruchamiania aplikacji Amazon WorkSpaces Applications wybierz ikonę 
Ustawienia (Setting), a następnie wybierz opcję Przełącz do trybu klasycznego (Switch to classic mode).
2.Po przełączeniu do trybu klasycznego okno Application Launcher zamyka się i otwiera okno sesji wirtualnego pulpitu Amazon WorkSpaces Applications. Każda aplikacja przesyłana strumieniowo w trybie aplikacji natywnej otwiera się w oknie wirtualnego pulpitu Amazon WorkSpaces Applications.
Aby przejść z trybu klasycznego do trybu aplikacji natywnej
1.W lewym górnym rogu okna sesji Amazon WorkSpaces Applications wybierz ikonę Ustawienia (Setting), a następnie wybierz opcję Przełącz do trybu aplikacji natywnej (Switch to native application mode).
2.Po przełączeniu z trybu klasycznego z powrotem do trybu aplikacji natywnej okno wirtualnego pulpitu Amazon WorkSpaces Applications zostanie zamknięte i otwarte zostanie okno Application Launcher aplikacji Amazon WorkSpaces Applications. Każda aplikacja przesyłana strumieniowo w trybie klasycznym otworzona zostanie we własnym osobnym oknie.