Po wybraniu grupy ustawień 
(Typy rejestrów) na drzewku ustawień, w prawej części okna pojawi się lista rejestrów dokumentów. W oknie tym można dodawać nowy rejestr i utworzyć jego definicję, usuwać rejestr albo zmieniać jego definicję. Definiując rejestr określa się, czy jest on aktywny, a także skrót i nazwę rejestru oraz jego rodzaj.
Podwójne kliknięcie w polu rejestr w Finanse i Księgowość otwiera okno Rejestry w FK, w którym można przypisać rejestrowi w programie handlowym odpowiedni rejestr w programie Finanse i Księgowość.
Program Handel obsługuje następujące rodzaje rejestrów:
•Rejestry magazynowe – Wewnętrzne, Zewnętrzne
•Rejestry sprzedaży – Podlega VAT, Nie podlega VAT, Eksport 0%, Podlega VAT (+ 180dni).
•Rejestry zakupu – Import, Podlega VAT, Nie podlega VAT.