Wystawiony dokument można anulować (unieważnić) po wybraniu przycisku Anuluj bieżący dokument w oknie Operacje, a następnie po podaniu powodu anulowania i potwierdzeniu operacji. Jeśli dokument został zaznaczony jako wyeksportowany do programu MK, wówczas pojawi się ostrzeżenie, ale jego anulowanie będzie możliwe. Dokumenty anulowane zostaną pominięte przy eksportowaniu do programu MK.
Dokument anulowany jest oznaczony czerwonym "stemplem" ANULOWANO, a jego numer na liście wyboru jest zapisany pismem pochyłym.